Balkan Araştırmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi’nin vizyonu; Kırklareli Üniversitesi’nin kurumsal vizyon ve değerlerini özümseyerek, Balkan çalışmaları alanında ulusal ve uluslararası düzeyde saygın, referans gösterilen ve güvenilir bir araştırma merkezi olmaktır. Merkez; Balkan coğrafyasına özgü tarih, dil, din, kültür, sanat, sosyal yapı ve ekonomi gibi alanlarda nitelikli ve özgün bilimsel çalışmalar üretmeyi; bilim, sanat ve kültür alanlarında disiplinlerarası yaklaşımla bilgi üretimini teşvik etmeyi ve bu birikimi akademik ve toplumsal düzeyde yaygınlaştırmayı hedeflemektedir. Ayrıca, Balkan ülkelerindeki üniversite ve araştırma kurumlarıyla kurumsal ve sürdürülebilir iş birlikleri geliştirerek ortak projeler ve bilimsel faaliyetler yoluyla bölgesel akademik etkileşimi güçlendirmeyi amaçlamaktadır.